| Agrostis juressi;n.a. |
| Armeria pseudoarmeria;Anexo II, Anexo IV |
| Armeria welwitschii;n.a. |
| Asplenium hemionitis;Anexo IV |
| Aster aragonensis;n.a. |
| Carduus lusitanicus subsp. broteroi;n.a. |
| Centaurea lusitanica;n.a. |
| Cheirolophus uliginosus;n.a. |
| Coincya cintrana;Anexo II, Anexo IV |
| Crepis pusilla;Anexo II, Anexo IV |
| Daphne laureola;n.a. |
| Daucus carota subsp. halophilus;n.a. |
| Daveaua anthemoides;n.a. |
| Deschampsia stricta;n.a. |
| Dianthus cintranus subsp. barbatus;n.a. |
| Dianthus cintranus subsp. cintranus;Anexo II, Anexo IV |
| Euphorbia paniculata subsp. welwitschii;Anexo II, Anexo IV |
| Euphorbia paniculata subsp. welwitschii;n.a. |
| Euphorbia transtagana;Anexo II, Anexo IV |
| Iris xiphium var. lusitanica;Anexo V |
| Jonopsidium acaule;Prioritária, Anexo IV |
| Juncus valvatus var. valvatus;Anexo II, Anexo IV |
| Klasea boetica subsp. lusitanica;n.a. |
| Limonium laxiusculum;n.a. |
| Linaria amethystea subsp. multipunctata;n.a. |
| Narcissus bulbocodium;Anexo V |
| Oenanthe globulosa;n.a. |
| Omphalodes kuzinskyanae;Anexo II, Anexo IV |
| Phalaris coerulescens subsp. lusitanica;n.a. |
| Prunus lusitanica subsp. lusitanica;n.a. |
| Quercus coccifera subsp. rivasmartinezii;n.a. |
| Ruscus aculeatus;Anexo V |
| Saxifraga cintrana;Anexo II, Anexo IV |
| Scrophularia sublyrata;n.a. |
| Silene cintrana;Anexo II, Anexo IV |
| Silene longicilia;Anexo II, Anexo IV |
| Thymus villosus subsp. villosus;Anexo IV |
| Triglochin laxiflorum;n.a. |
| Ulex densus;Anexo V |
| Ulex jussiaei;n.a. |
| Utricularia australis;n.a. |
| Vaccaria hispanica;n.a. |
| Verbascum litigiosum;Anexo II, Anexo IV |
